四川華西醫院作為重要的醫學科研和技術創新基地,在中國更佳醫院排行榜(復旦版)的科研得分上連續12年名列全國,在Nature INDEX排行榜上,華西醫院名列全球第14位,中國位。在為長期基因研究工作鋪平道路的實踐中,華西醫院著眼于提高基因數據的分析能力及優化數據分析平臺的建設成本,攜手紫光股份旗下新華三集團打造高性能計算平臺,充分發揮基因測序整體解決方案優勢,全力支持精準醫療業務和研究的開展。
效率與成本兼顧
新華三為基因測序定制高性能計算平臺
為進一步提升基因測序的效率,華西醫院決定在已有全球領先的基因測序平臺上,配合精準醫學數據平臺的建設,側重于利用“超多核CPU+GPU”的強大算力,打造高性能計算平臺,既要能夠立竿見影地顯著提升基因測序和分析能力,還要控制好建設成本,提高資金的使用效率和平臺建設的延續性。在充分了解客戶業務場景,新華三集團根據實際部署情況作出了針對性的方案設計對硬件組件、軟件環境和管理平臺進行全面整合,在滿足性能的前提下,能夠顯著提高基因測序的效率。
強大內核 支撐高性能計算平臺加速醫學成果轉化
新華三集團采用4臺搭載8塊NVIDIA A100 GPU和2顆AMD EPYC 7742(一共128個核心、256個線程)處理器的H3C UniServer R5500 G5人工智能服務器打造出性能強大的高性能計算平臺,從CPU、GPU的算力調度與整合,到先進的軟件和算法,為數十個科學家團隊提供包括胚系變異檢測、體細胞變異檢測等場景的算力服務,全力支持科學家團隊的科研工作,加速助力醫學成果的轉化。
多核異構高性能:一直以來,計算能力是基因組分析的瓶頸,而使用GPU加速則可以突破這一瓶頸。新華三的高性能計算平臺結合使用AMD EPYC 7742的多核心計算能力和NVIDIA A100 GPU強大的并行分析能力,核心胖節點由10臺R8900 G3關鍵業務服務器組成胖節點集群來承載,領先的8CPU+8GPU均衡架構,超過24TB大內存空間,滿足HPC領域各種科研而帶來的海量和復雜計算對高算力的需求。
軟硬結合簡部署:華西醫院高性能計算平臺所采用的R5500 G5服務器支持NVIDIA HGX A100 8-GPU模組,是首批入選英偉達認證系統的服務器機型之一,可獲得英偉達NVAIE在內的整個軟件堆棧的企業級支持,包括對開源代碼的支持,大大減輕再使用前針對業務場景的部署和前期環境搭建,可以滿足華西醫院兼顧效率和成本的要求。
智慧算力調度作業效率提高32%:新華三集團以智能的傲飛高性能計算管理平臺——AI資源區分管理(AIOS)實現了整個HPC集群的集中管理和智能調度,使整個系統像一臺機器一樣,實現統一的監測、管理、部署,顯著地提升系統維護效率,而且能夠采用圖形界面(GUI)的模式,更加簡便和直觀地操作計算節點控制臺,精準全面地呈現HPC集群的總體狀態。同時對HPC批量作業和AI容器作業進行智能調度,作業效率提升32%。
高性能計算平臺為華西醫院的科學研究注入強大的動力,發揮其在多模態組學數據分析和基因應用等領域的學術優勢,加速精準醫療大數據在醫學上的廣泛應用。未來,新華三集團將持續推進“云智原生”戰略的深化,以內生智能的智慧計算,夯實數字大腦底座,助推精準醫學領域更多科研突破,以數字化之力支撐高技術領域的長遠發展。
文章轉自微信公眾賬號:新華三 由華三代理商整理發布